同尾酶
同尾酶(英语:Isocaudomers)是指一组识别序列不同,但切出的粘性末端相同的限制性內切酶。比如限制酶 Mbo I 和 BamH I 就是一对同尾酶:
Mbo I
N*GATC N
N CTAG*N
BamH I
G*GATC C
C CTAG*G
N 代表任意四种核苷酸,表示 Mbo I 酶的切割不依赖于此处的碱基。在切割后,两种酶都生成了相同的四个碱基长度的粘性末端 - GATC。这使得两个DNA片段可以在退火的时候配对起来,再由DNA连接酶连接起来,可以通过这一方法消去DNA序列中的限制性位点,如下面的例子:
Not I
GC*GGCC GC
CG CCGG*CG
Bsp120 I
G*GGCC C
C CCGG*G
在这个例子中,两种酶都生成了四个碱基长度的粘性末端 - CCGG,可以相互配对。在经过连接酶连接之后,会形成如下结果的DNA序列:
GCGGCCC
GCCCGGG
此时该段序列既无法被 Not I 识别,也无法被 Bsp120 I 识别,此处的限制性位点就被消去了。
同尾酶的其它例子[1]:
限制酶 | 粘性末端 |
---|---|
BamHI/BclI/BglII/BstYI/DpnII | 3'…CTAG |
NcoI/BspHI/FatI/PciI | 3'…GTAC |
NdeI/AseI/BfaI/Csp6I/MseI | 3'…AT |
XbaI/AvrII/NheI/SpeI/StyI | 3'…GATC |
XhoI/PspXI/SalI | 3'…AGCT |
AscI/BssHII/MluI | 3'…GCGC |
参考文献
^ https://www.neb.com/tools-and-resources/selection-charts/compatible-cohesive-ends-and-generation-of-new-restriction-sites
这是一篇與化学相關的小作品。你可以通过编辑或修订扩充其内容。 |
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