限制酶







黏狀末端(sticky end)。圖為EcoRI的切位。




平滑末端(blunt end)。圖為SmaI的切位。


限制酶英语:restriction enzyme)又稱限制內切酶限制性內切酶restriction endonuclease),全稱限制性核酸內切酶[1],是一種能將雙股DNA切開的酶。切割方法是將醣類分子與磷酸之間的鍵結切斷,進而於兩條DNA鏈上各產生一個切口,且不破壞核苷酸與鹼基。切割形式有兩種,分別是可產生具有突出單股DNA的黏狀末端,以及末端平整無凸起的平滑末端。[2]。由於斷開的DNA片段可由另一種稱為DNA連接酶的酵素黏合,因此染色體或DNA上不同的限制片段,得以經由剪接作用而結合在一起。


限制酶在分子生物學與遺傳工程領域有廣泛的應用,此類酵素最早發現於某些品系的大腸桿菌體內,這些品系能夠「限制」噬菌體對其感染,因此得名。科學家認為限制酶是細菌所演化出來對抗病毒感染,並幫助將已殖入的病毒序列移除的機制。是限制修飾系統(restriction modification system)的一部分。約翰霍普金斯大學的丹尼爾·那森斯、漢彌爾頓·史密斯與伯克利加州大學的沃納·亞伯因為限制酶的發現及研究,而共同獲得1978年的諾貝爾生理學或醫學獎。此酵素最早的應用之一,是用來將胰島素基因轉殖到大腸桿菌,使其具備生產人類胰島素的能力。




目录






  • 1 命名


  • 2 類型


    • 2.1 第一型限制酶


    • 2.2 第二型限制酶


    • 2.3 第三型限制酶




  • 3 例子


  • 4 參考文獻


  • 5 外部連結





命名


限制酶的命名是根據細菌種類而定,以EcoRI為例:























E Escherichia (屬)
co coli (種)
R RY13 (品系)
I 首先發現 在此類細菌中發現的順序


類型


根據限制酶的結構,輔因子的需求切位與作用方式,可將限制酶分為三種類型,分別是第一型(Type I)、第二型(Type II)及第三型(Type III)。



第一型限制酶


同時具有修飾(modification)及限制性切割(restriction)的作用;另有识别(recognize)DNA上特定鹼基序列的能力,通常其切割位(cleavage site)距離识别位点(recognition site)可達數千個鹼基之遠,并不能准确定位切割位点,所以并不常用。例如:EcoB、EcoK。



第二型限制酶


只具有限制性切割的作用,修飾作用由其他酶進行。所识别的位置多為短的迴文序列(palindrome sequence);所剪切的鹼基序列通常即為所识别的序列。是遺傳工程上,實用性較高的限制酶種類。例如:EcoRI、HindIII。



第三型限制酶


與第一型限制酶類似,同時具有修飾及识别切割的作用。可识别短的不對稱序列,切割位與识别序列約距24-26個鹼基對,并不能准确定位切割位点,所以并不常用。例如:EcoPI、HinfIII。



例子






















































































































名称 來源 识别序列 切割位点

EcoRI

Escherichia coli

5'GAATTC
3'CTTAAG


5'---G     AATTC---3'
3'---CTTAA G---5'


BamHI

Bacillus amyloliquefaciens

5'GGATCC
3'CCTAGG


5'---G     GATCC---3'
3'---CCTAG G---5'


HindIII

Haemophilus influenzae

5'AAGCTT
3'TTCGAA


5'---A     AGCTT---3'
3'---TTCGA A---5'


TaqI

Thermus aquaticus

5'TCGA
3'AGCT


5'---T   CGA---3'
3'---AGC T---5'


NotI

Nocardia otitidis

5'GCGGCCGC
3'CGCCGGCG


5'---GC   GGCCGC---3'
3'---CGCCGG CG---5'


HinfI

Haemophilus influenzae

5'GANTC
3'CTNAG


5'---G   ANTC---3'
3'---CTNA G---5'


Sau3A

Staphylococcus aureus

5'GATC
3'CTAG


5'---     GATC---3'
3'---CTAG ---3'


PovII*

Proteus vulgaris

5'CAGCTG
3'GTCGAC


5'---CAG  CTG---3'
3'---GTC GAC---5'


SmaI*

Serratia marcescens

5'CCCGGG
3'GGGCCC


5'---CCC  GGG---3'
3'---GGG CCC---5'


HaeIII*

Haemophilus egytius

5'GGCC
3'CCGG


5'---GG  CC---3'
3'---CC GG---5'


AluI*

Arthrobacter luteus

5'AGCT
3'TCGA


5'---AG  CT---3'
3'---TC GA---5'


EcoRV*

Escherichia coli

5'GATATC
3'CTATAG


5'---GAT  ATC---3'
3'---CTA TAG---5'


KpnI[3]

Klebsiella pneumonia

5'GGTACC
3'CCATGG


5'---GGTAC  C---3'
3'---C CATGG---5'


PstI[3]

Providencia stuartii

5'CTGCAG
3'GACGTC


5'---CTGCA  G---3'
3'---G ACGTC---5'


SacI[3]

Streptomyces achromogenes

5'GAGCTC
3'CTCGAG


5'---GAGCT  C---3'
3'---C TCGAG---5'


SalI[3]

Streptomyces albue

5'GTCGAC
3'CAGCTG


5'---G  TCGAC---3'
3'---CAGCT G---5'


SphI[3]

Streptomyces phaeochromogenes

5'GCATGC
3'CGTACG


5'---G  CATGC---3'
3'---CGTAC G---5'


XbaI[3]

Xanthomonas badrii

5'TCTAGA
3'AGATCT


5'---T  CTAGA---3'
3'---AGATC T---5'

* = 平滑末端(blunt ends)


參考文獻





  1. ^ 高中《生物》選修 3 - 生物技術前沿,人民教育出版社


  2. ^ http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/31/7/1805


  3. ^ 3.03.13.23.33.43.5 Molecular cell biology. Lodish, Harvey F. 5. ed. : - New York : W. H. Freeman and Co., 2003, 973 s. b ill. ISBN 0-7167-4366-3




外部連結



  • Restriction Enzyme Digestion of DNA Protocol


  • Restriction enzyme tools[永久失效連結]

  • Restriction enzymes: protein data bank molecule of the month


  • REBASE - The Restriction Enzyme Database

  • Restriction enzyme finder


  • pDRAW32 - Freeware software for restriction analysis


  • WatCut - An online tool for restriction analysis


  • Restriction digest of DNA - Online tool, free source code (PHP)


  • Restriction Homepage - Six different tools


  • Restriction Endonucleases: Molecular Scissors for Specifically Cutting DNA - a review from the Science Creative Quarterly

  • Type I Restriction-Modification Systems - Home Page


  • MeSH(醫學主題詞)上面的DNA+Restriction+Enzymes(美式英语)






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