抗原表位




抗原表位英语:antigenic epitope),简称“表位”,也称为“抗原决定簇”(antigenic determinant),是指抗原表面上决定抗原特异性的化学基团。抗原表位可被免疫系统(尤其是抗体、B细胞或者T细胞)识别。抗体中能识别抗原表位的区域叫做“互补位”或“抗体决定簇”。尽管通常抗原表位是指外来蛋白质等物质的其中一部分,但只要能被自身免疫系统所识别的表位,也被归为抗原表位。


蛋白质抗原的表位根据它们的结构以及与互补位的交互作用,被分为构象表位和线性表位这两种类型[1]。其中构象表位由抗原氨基酸序列中的不连续部分组成,因此互补位和抗原表位的交互作用是基于表面的三维特征和形状,或者是抗原的三级结构。大部分的抗原表位都属于构象表位。与此相反,线性表位是由一段连续的抗原氨基酸序列构成,与抗原的交互作用的基础是其一级结构。




目录






  • 1 功能


    • 1.1 T细胞表位


    • 1.2 交叉反应




  • 2 抗原表位的绘制


  • 3 抗原标记


  • 4 参见


  • 5 引用


  • 6 外部链接


    • 6.1 抗原数据库







功能



T细胞表位


T细胞抗原表位出现在抗原呈现细胞上,这种抗原将会和主要组织相容性复合体(MHC)相结合。由I型主要组织相容性复合体所呈现的T细胞抗原表位通常是由8至11个氨基酸长度的多肽,而II型主要组织相容性复合体所呈现的T细胞抗原表位相对更长,由13-17个氨基酸组成[2],而非经典主要组织相容性复合体则呈现非多肽类的抗原表位,例如糖脂。



交叉反应


抗原表位有时候会发生交叉反应,这一特点通过抗独特型抗体的调控,被免疫系统所利用。这一理论最初是由诺贝尔奖获得者尼尔斯·杰尼所提出的。如果抗体和某个抗原的表位结合,这一互补区会变成抗原表位被另一个抗体所捕获。如果第二个抗体是一个IgM类型的抗体,则这一结合会提升免疫系统的响应;而如果第二个抗体是IgG类型的抗体,则这一结合会降低免疫系统的响应。



抗原表位的绘制



抗原表位可以通过蛋白质阵列文库等技术进行绘制。同时,目前正在大力开发一些可靠的工具,用于预测蛋白质的抗原表位。



抗原标记


抗原表位通常会被用于蛋白质组学以及其它基因产品的研究当中,是指通过DNA重组技术,能够被普通抗体所识别的编码抗原表位的基因序列。抗原标记可以被融合到某段基因当中,其后该表位被合成为蛋白质或者其它基因产品的一部分,上面的抗原表位标记会被抗体或者其它基因产品所识别,使得定位、提纯以及进一步的分子鉴定等实验室技术变得可行。用于该目的的抗原表位通常为Myc标记、HA标记、FLAG标记、GST标记、6xHis标记[3]以及OLLAS标记[4]



参见





  • 互补位(Paratope)


  • 模拟表位(Mimotope)


  • 抗原表位作图(Epitope mapping)


  • 构象表位(Conformational epitope)


  • 线性表位(Linear epitope)


  • 多株B细胞反应(Polyclonal B cell response)


  • 嗅觉表位(Odotope)


  • 蛋白標籤(Protein tag)




引用




  1. ^ Jian Huang, Wataru Honda. CED: a conformational epitope database. BMC Immunology. 2006-04-07, 7: 7 [2018-04-02]. ISSN 1471-2172. doi:10.1186/1471-2172-7-7. 


  2. ^ Alberts. Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science. 2002: 1401. 


  3. ^ Walker, John; Ralph Rapley. Molecular biomethods handbook. Humana Press. 2008: 467. ISBN 1603273743.  引文使用过时参数coauthors (帮助)


  4. ^ Novus, Biologicals. OLLAS Epitope Tag. Novus Biologicals. [23 November 2011]. 



外部链接



  • 与抗原的构型相结合抗体(《詹韦免疫生物学》3.8节)

  • 抗原可以和口袋状、沟槽状以及大片表面的抗体结合区相结合(《詹韦免疫生物学》图3.8)



抗原数据库



  • MHCBN: A database of MHC/TAP binder and T-cell epitopes

  • Bcipep: A database of B-cell epitopes

  • SYFPEITHI - First online database of T cell epitopes

  • IEDB - Database of T and B cell epitopes with annotation of recognition context - NIH funded

  • ANTIJEN - T and B cell epitope database at the Jenner institute, UK

  • IMGT/3Dstructure-DB - Three-dimensional structures of B and T cell epitopes with annotation of IG and TR - IMGT, Montpellier, France

  • SEDB: A Structural Epitope Database- Pondicheery University, DIT funded

  • 抗原表位



  • MeSH(醫學主題詞)上面的Epitopes(美式英语)




Comments

Popular posts from this blog

Information security

Volkswagen Group MQB platform

刘萌萌