抗原表位
抗原表位(英语:antigenic epitope),简称“表位”,也称为“抗原决定簇”(antigenic determinant),是指抗原表面上决定抗原特异性的化学基团。抗原表位可被免疫系统(尤其是抗体、B细胞或者T细胞)识别。抗体中能识别抗原表位的区域叫做“互补位”或“抗体决定簇”。尽管通常抗原表位是指外来蛋白质等物质的其中一部分,但只要能被自身免疫系统所识别的表位,也被归为抗原表位。
蛋白质抗原的表位根据它们的结构以及与互补位的交互作用,被分为构象表位和线性表位这两种类型[1]。其中构象表位由抗原氨基酸序列中的不连续部分组成,因此互补位和抗原表位的交互作用是基于表面的三维特征和形状,或者是抗原的三级结构。大部分的抗原表位都属于构象表位。与此相反,线性表位是由一段连续的抗原氨基酸序列构成,与抗原的交互作用的基础是其一级结构。
目录
1 功能
1.1 T细胞表位
1.2 交叉反应
2 抗原表位的绘制
3 抗原标记
4 参见
5 引用
6 外部链接
6.1 抗原数据库
功能
T细胞表位
T细胞抗原表位出现在抗原呈现细胞上,这种抗原将会和主要组织相容性复合体(MHC)相结合。由I型主要组织相容性复合体所呈现的T细胞抗原表位通常是由8至11个氨基酸长度的多肽,而II型主要组织相容性复合体所呈现的T细胞抗原表位相对更长,由13-17个氨基酸组成[2],而非经典主要组织相容性复合体则呈现非多肽类的抗原表位,例如糖脂。
交叉反应
抗原表位有时候会发生交叉反应,这一特点通过抗独特型抗体的调控,被免疫系统所利用。这一理论最初是由诺贝尔奖获得者尼尔斯·杰尼所提出的。如果抗体和某个抗原的表位结合,这一互补区会变成抗原表位被另一个抗体所捕获。如果第二个抗体是一个IgM类型的抗体,则这一结合会提升免疫系统的响应;而如果第二个抗体是IgG类型的抗体,则这一结合会降低免疫系统的响应。
抗原表位的绘制
抗原表位可以通过蛋白质阵列文库等技术进行绘制。同时,目前正在大力开发一些可靠的工具,用于预测蛋白质的抗原表位。
抗原标记
抗原表位通常会被用于蛋白质组学以及其它基因产品的研究当中,是指通过DNA重组技术,能够被普通抗体所识别的编码抗原表位的基因序列。抗原标记可以被融合到某段基因当中,其后该表位被合成为蛋白质或者其它基因产品的一部分,上面的抗原表位标记会被抗体或者其它基因产品所识别,使得定位、提纯以及进一步的分子鉴定等实验室技术变得可行。用于该目的的抗原表位通常为Myc标记、HA标记、FLAG标记、GST标记、6xHis标记[3]以及OLLAS标记[4]。
参见
互补位(Paratope)
模拟表位(Mimotope)
抗原表位作图(Epitope mapping)
构象表位(Conformational epitope)
线性表位(Linear epitope)
多株B细胞反应(Polyclonal B cell response)
嗅觉表位(Odotope)
蛋白標籤(Protein tag)
引用
^ Jian Huang, Wataru Honda. CED: a conformational epitope database. BMC Immunology. 2006-04-07, 7: 7 [2018-04-02]. ISSN 1471-2172. doi:10.1186/1471-2172-7-7.
^ Alberts. Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science. 2002: 1401.
^ Walker, John; Ralph Rapley. Molecular biomethods handbook. Humana Press. 2008: 467. ISBN 1603273743. 引文使用过时参数coauthors (帮助)
^ Novus, Biologicals. OLLAS Epitope Tag. Novus Biologicals. [23 November 2011].
外部链接
- 与抗原的构型相结合抗体(《詹韦免疫生物学》3.8节)
- 抗原可以和口袋状、沟槽状以及大片表面的抗体结合区相结合(《詹韦免疫生物学》图3.8)
抗原数据库
- MHCBN: A database of MHC/TAP binder and T-cell epitopes
- Bcipep: A database of B-cell epitopes
- SYFPEITHI - First online database of T cell epitopes
- IEDB - Database of T and B cell epitopes with annotation of recognition context - NIH funded
- ANTIJEN - T and B cell epitope database at the Jenner institute, UK
- IMGT/3Dstructure-DB - Three-dimensional structures of B and T cell epitopes with annotation of IG and TR - IMGT, Montpellier, France
- SEDB: A Structural Epitope Database- Pondicheery University, DIT funded
- 抗原表位
MeSH(醫學主題詞)上面的Epitopes(美式英语)
|
Comments
Post a Comment