嗜極生物






生活在黃石國家公園裏的嗜熱生物


嗜極生物(英文:Extremophile),或者稱作嗜極端菌,是可以(或者需要)在極端環境英语extreme environment中生長繁殖的生物,通常爲單細胞生物。[1][2]与此相对的,在较为温和的环境中生活的生物,可称为中温生物(Mesophile)中性生物(Neutrophile)。“極端”環境的定義是人類中心論的,而對這些生物本身而言,這些環境卻是很普通的。也就是說,嚴格來講,這些“極端環境”是一些生物可以生存的地方,不論人類認爲這些地方是普通的還是極端的。舉例來説,人可以被分類爲嗜溫好氧生物。


當我們描述這些從人類看來極端的環境中生存的生物時,多數嗜極生物屬於古菌,儘管有時候這個詞包含一些細菌和真核生物。並非所有的嗜極生物都是單細胞的。比如嗜冷的蛩蠊(昆蟲)和南極磷蝦(甲殼類),以及能在任何環境都能存活的熊蟲(緩步動物門)就屬於嗜極後生動物。




目录






  • 1 嗜極生物的種類


  • 2 参看


  • 3 参考资料


  • 4 扩展阅读


  • 5 外部链接





嗜極生物的種類


對於嗜極生物有很多種分類方法,都是根據其選擇與其它生物“正常”環境不同的特性分類的。這些分類並不互相排斥。比如,在地下深處高溫巖石中生活的生物既是嗜熱生物,也是嗜壓生物



  • 氧氣含量(最终电子受容体)


    • 好氧生物(Aerobic organism):在有氧存在的环境下生长的生物。


      • 专性需氧生物(Obligate aerobe):在10~20%有氧环境下生长的生物。


      • 兼性需氧生物(Facultative aerobe):在无氧到20%有氧环境下生长的生物。


      • 微需氧微生物(Microaerophile):需要在2~10%有氧环境下生长的生物。


      • 纳需氧微生物(Nanaerobe):需要在2%以下有氧环境下生长的生物。




    • 厭氧生物(Anaerobe organism):不需要氧氣生長的生物。


      • 专性厌氧生物(Obligate anaerobe):需要完全缺氧環境維持生活。


      • 兼性厌氧生物(Facultative anaerobie):在有氧的環境中進行有氧呼吸,在缺氧的環境下,部份會進行發酵,部份則進行無氧呼吸。


      • 耐氧厌氧生物(Aerotolerant):可以在有氧氣的環境下生存,但牠們不會使用氧氣作為最终电子受容体。





  • 營養類型


    • 无机自养生物(lithoautotroph):使用無機物作爲電子來源利用无机碳源製造生物量。


      • 化能自养生物(Chemolithotrophs):利用化學能量固定无机碳源而製造生物量


      • 光能自养生物(Photolithotrophs):使用光作爲能量來源,以無機物(水)作爲電子供体且利用有機物碳源。




    • 无机异养生物(lithoheterotroph):使用無機物作爲電子來源利用有機物碳源製造生物量。


      • 化能异养生物(Chemoorganotrophs):利用化學能量,利用有機物碳源。


      • 光能异养生物(Photoorganotrophs):使用光作爲能量來源,利用有機物碳源。




    • 混合营养生物(Mixotroph):同时进行無機营养与有機营养的生物。



  • 温度

    • 高温生物(Thermophilc organisms):可以在60℃以上生活的生物。


      • 超嗜熱生物(Hyperthermophile):可以在更高的溫度下(約85~130℃)生活的生物,最低55℃以上。


      • 极端嗜热生物(Extremely Thermophile):可以在比较高的溫度下(約80~85℃)生活的生物,最低40℃以上。


      • 专性嗜熱生物(Obligetely Thermophile):可以在相對高的溫度下(約60~80℃)生活的生物,最适65~70℃,最低40℃以上。


      • 兼性嗜热生物(Thermotroph,Facultative Thermophile):最適生長溫度介於45℃~60℃之間,最高在50~65℃之间,最低30℃以下。


      • 耐热生物(Thermotrophs,Thermotolerant):最适生长温度仍在中温范围内,最高在45~55℃,最低30℃以下。




    • 中温生物(Mesophile):可以在15-60℃生活的生物。

    • 低温生物(Psychrophilic organisms):可以在15℃以下生活的生物。


      • 耐冷生物(Psychrotrophs,Psychrotolerant):最高生长温度20℃以上,最适15℃以上,在0~5℃可生长繁殖。


      • 兼性嗜冷生物(Psychrotroph,Facultative Psychrophil):能在0~7℃下生長,最适为20~40℃,最高高於35℃。


      • 专性嗜冷生物(Obligetely Psychrophile):最适生长温度15℃或更低,最高生长温度20℃或更低,最低生长温度0℃或以上。


      • 极端嗜冷生物(Extremely Psychrophile):能在-15~10℃下生長,最适生长温度-2℃以上,10℃则不能生长。


      • 嗜冰生物(Cryophiles):生长温度-10℃以下,有些适应温度低于-20℃~-200℃。





  • pH值

    • 嗜酸生物(Acidophilc organisms):


      • 嗜硫酸生物(Sulphophiles):代谢产物是硫酸,具有高度酸性pH值接近0。


      • 极端嗜酸生物(Extreme Acidophiles):生活在火山地区的酸性热水中,能生活在pH值1以下的环境中。


      • 专性嗜酸生物(Obligate Acidophiles):生長上限pH值小於等於3,最適宜生长pH值在1.0~2.5的环境中。


      • 嗜酸生物(Acidophiles):在pH3~5之间最适或生长良好。


      • 兼性嗜酸生物(Facultive Acidophiles):最适生长pH小於3并且在中性环境中也能生长。


      • 耐酸生物(Acidtolerant):生长在pH3~5,pH3以下不能生长,但在中性pH下也能生活的生物。




    • 中性生物(Neutrophile):最適生長pH值5~9。

    • 嗜碱生物(Alkaliphilc organisms):


      • 耐碱生物(Aalkalotolerant):在pH7~9生长,pH9.5以上不能生长,而生长的最适pH为中性或接近中性的生物。


      • 兼性嗜碱生物(Facultive Alkaliphiles):最适生长pH大於等於10并且在中性环境中也能生长。


      • 嗜碱生物(Alkaliphiles):在pH9~10之间最适或生长良好,在pH6.5左右不能或仅能缓慢生长。


      • 专性嗜鹼生物(Obligate Alkaliphiles):最適生長pH值大於等於10,在pH低于8~9时不生长。


      • 极端嗜碱生物(Extreme Alkaliphiles):多数生活在盐碱湖或碱湖、碱池中,生活环境pH值可达11.5以上。





  • 盐度


    • 非嗜盐生物(Non-Halophile):最适生长盐度即氯化钠浓度小於2%。


    • 耐盐生物(Halotolerant):既能在低盐度下正常生活4,又能在2~12%(0.2~2.5mol/L)氯化钠浓度高盐度环境下生活。


    • 极端耐盐生物(Extreme Halotolerant):既能在低盐度下正常生活,又能耐受12%(2.5mol/L)以上氯化钠浓度。


    • 嗜鹽生物(Halophile):需要最少0.2M鹽濃度生活的生物。


      • 兼性嗜盐生物(Facultative Halophiles):既能在0.1mol/L氯化钠浓度低盐度下正常生活,又能在(0.5~2.5mol/L)高盐度环境下生活。


      • 低度嗜盐生物(Slight Halophiles):耐受2%~3%(0.2~0.5mol/L)氯化钠浓度。


      • 中度嗜盐生物(Moderate Halophiles,Mesohalophilic):耐受3%~12%(0.5~2.5mol/L)氯化钠浓度。


      • 边缘极端嗜盐生物(Borderline Extreme Halophiles):最适合(1.5~4mol/L)氯化钠浓度中生长。


      • 极端嗜盐生物(Extreme Halophiles):耐受12%~30%(2.5~5.2mol/L)氯化钠浓度。





  • 渗透压(水分活度Aw,也称水活性)


    • 耐高渗生物(Osmotolerant):在普通环境下生长,也能耐受高渗透压的环境。水活性很低。


    • 嗜高渗生物(Osmophile):适应高渗透压的环境下,如高糖浓度的环境下生长。水活性很低。



  • 營養物濃度


    • 富营养生物(Copiotroph):在營養物濃度很高(10gC/L)的環境中生活的生物。


    • 兼性贫营养生物(Facultative Oligotroph):一些在富营养培养基中经反复培养后也能适应并生长的贫营养生物。


    • 专性贫营养生物(Obligate Oligotroph):在營養物濃度很低(1~15mgC/L)的環境中生活的生物。




  • 岩内生物(Endolith):生活在岩石内部的生物。


    • 裂隙岩内生物(Chasmoendolith):生活在岩石的裂隙和裂缝的生物。


    • 隐藏岩内生物(Cryptoendolith):生活在多孔岩石腔体空洞结构的生物。


    • 真岩内生物(Euendolith):凿岩生物,进入到岩石内部,形成符合的身体形状的隧道。




  • 石下生物(Hypolith):生活在沙漠地區或極地岩石之下的生物。

  • 压力(静水压)


    • 常压生物:最适生长压力为1个大气压的正常压力。


    • 耐壓生物(Piezophilerant):最适压力为正常大气压,但也能耐受500个大气压以下的高压力。


    • 嗜壓生物(Piezophile):最適生長於高壓環境的生物。


      • 兼性嗜壓生物(Facultative Piezophiles):正常大气压下能生活,500个大气压上也能生活。


      • 专性嗜壓生物(Obligate Piezophiles):最适生长压力为500个大气压以上,最高可达1000个大气压以上,低于40个大气压不能生活。



    • 嗜重生物(Barophile)



  • 重力


    • 耐超重生物(Hypergravity organisms,Hyperaccelerations):在超过1.5万倍至40万倍地球重力的超重环境下可以生存。


    • 耐低重力生物(Hypogravity organisms):在低重力的环境下正常生存。



  • 辐射

    • 耐輻射生物(Radioresistant):可以忍受5000戈瑞以上高強度輻射的生物,对紫外线、电离辐射等都具有极强抗性的。


  • 真空
    • 耐真空生物


  • 脱水
    • 耐脱水生物


  • 干燥

    • 耐旱生物(Xerophile):只需要少量水分就能生活的生物。


  • 极端化学环境


    • 耐毒性生物(Toxitolerante):在有毒物质存在时仍能生长的生物。有毒物质的耐受值(Toxitoleranz)1(非常敏感)到9(高耐受性)。


    • 耐二氧化碳生物(Capnophile):在纯二氧化碳环境仍能生长的生物。


    • 耐甲烷生物(Methanophile):适合于高浓度的甲烷环境的生物。


    • 耐金屬生物(Metallotolerant):可以忍受高濃度重金屬,如銅、鎘、砷、鋅的生物。例子如:Ferroplasma sp., Cupriavidus metallidurans和GFAJ-1.[3][4][5]


    • 耐有机溶剂生物(Organic-solvent-tolerant,OST):可适应各种亲脂性溶剂如烷烃、烷醇、芳香烃的毒性。



  • 多种极端环境


    • 兼性嗜极生物(Facultatire extremophilie):生命体能在两种或两种以上的极端环境条件下生存。

      • 嗜热嗜酸生物(Thermoacidophile)

      • 嗜热嗜碱生物(Thermoalkaliphile)

      • 嗜冷嗜碱生物(Psychroalkaliphile)

      • 嗜盐嗜碱生物(Haloalkaliphile)




    • 多重嗜极生物(Polyextremophile):生命体能在多种的极端环境条件下生存。




新确定的嗜(-philes)极端生物类型总是在不断增加。化妆品产品的污染是罕见的,但是在发胶中发现的Microbacterium hatanonis是一种特别的极端生物。[6]在沥青湖彼奇湖(Pitch Lake)中就有微生物生活,研究表明沥青湖中的极端微生物在106到107细胞/克。[7][8]最近一个具有硼耐受性的强嗜硼生物(Borophiles)细菌Bacillus boroniphilus英语Bacillus boroniphilus被发现。[9]研究这些嗜硼生物可能有助于阐明硼中毒和缺硼机制。



参看



  • 嗜食极端生物(Extremotroph)


参考资料





  1. ^ Rampelotto, P. H.(2010). Resistance of microorganisms to extreme environmental conditions and its contribution to Astrobiology. Sustainability, 2, 1602-1623.


  2. ^ Rothschild, L.J.; Mancinelli, R.L. Life in extreme environments. Nature 2001, 409, 1092-1101


  3. ^ Studies refute arsenic bug claim. BBC News. 9 July 2012 [10 July 2012]. 


  4. ^ GFAJ-1 Is an Arsenate-Resistant, Phosphate-Dependent Organism. Science. 8 July 2012 [10 July 2012]. doi: 10.1126/science.1218455.  引文使用过时参数coauthors (帮助); 参数|id=值左起第53位存在删除符 (帮助); Authors list列表中的|first1=缺少|last1= (帮助); 使用|coauthors=需要含有|author= (帮助)


  5. ^ Absence of Detectable Arsenate in DNA from Arsenate-Grown GFAJ-1 Cells. Science. 8 July 2012 [10 July 2012]. doi: 10.1126/science.1219861 .  引文使用过时参数coauthors (帮助); 参数|id=值左起第53位存在删除符 (帮助); Authors list列表中的|first1=缺少|last1= (帮助); 使用|coauthors=需要含有|author= (帮助)


  6. ^ Mohammad Abdul Bakir, Takuji Kudo and Yoshimi Benno. Microbacterium hatanonis sp. nov., isolated as a contaminant of hairspray. International Journal of Systemic and Evolutionary Microbiology. 2008, 58 (Pt 3): 654–658. PMID 18319473. doi:10.1099/ijs.0.65160-0. 


  7. ^ Microbial Life Found in Hydrocarbon Lake. the physics arXiv blog 15 April 2010.


  8. ^ Schulze-Makuch, Haque, Antonio, Ali, Hosein, Song, Yang, Zaikova, Beckles, Guinan, Lehto, Hallam. Microbial Life in a Liquid Asphalt Desert.


  9. ^ A novel highly boron tolerant bacterium, Bacillus boroniphilus sp. nov., isolated from soil, that requires boron for its growth. Extremophiles Vol. 11, p. 217-224.




扩展阅读




  • Wilson, Z. E. and Brimble, M. A. Molecules derived from the extremes of life. Nat. Prod. Rep. January 2009, 26 (1): 44–71. PMID 19374122. doi:10.1039/b800164m. 


  • Rossi M; 等. Extremophiles 2002. J Bacteriol. July 2003, 185 (13): 3683–9. PMC 161588. PMID 12813059. doi:10.1128/JB.185.13.3683-3689.2003.  引文格式1维护:显式使用等标签 (link)


  • Satyanarayana, T.; Raghukumar, C.; Shivaji, S. Extremophilic microbes: Diversity and perspectives. Current Science. July 2005, 89 (1): 78–90.  引文使用过时参数coauthors (帮助)


  • C.Michael Hogan. Extremophile. Encyclopedia of Earth, National Council of Science & the Environment, eds. E,Monosson & C.Cleveland. 2010. 



外部链接



  • Extreme Environments - Science Education Resource Center

  • Extremophile Research

  • Eukaryotes in extreme environments

  • The Research Center of Extremophiles

  • DaveDarling's Encyclopedia of Astrobiology, Astronomy, and Spaceflight

  • The International Society for Extremophiles

  • Idaho National Laboratory





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