古虫界

古虫界
篮氏贾第鞭毛虫，一种人体寄生虫
科学分类
总域：	新壁總域 Neomura
域：	真核域 Eukaryota
界：	古虫界 Excavata (Cavalier-Smith) Simpson, 2003
门
眼虫门 Euglenozoa 透色门 Percolozoa 槽虫门 Loukozoa 后滴门 Metamonada Malawimonas

古虫界（学名：Excavata）是单细胞真核生物的一个大的界^[1][2]。古虫界包含了许多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人体寄生虫。命名为「古虫」，是因为在真核生物的系统发生树处于底部位置，与古菌等外群关系较近，线粒体可能缺失或功能原始。

目录

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  1 特性
  


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  2 分类
  
  
  
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    2.1 Discoba或JEH亚界
    
  
  
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    2.2 后滴门
    
  
  
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    2.3 单系起源
    
  
  
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    2.4 马拉维单胞虫
    
  
  
  
  


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  3 参見
  


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  4 参考文献
  


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  5 外部链接
  

特性

许多古虫界的物种缺乏典型的线粒体，被称作「无线粒体原生生物」（amitochondriate），虽然大多数可能包含了功能上类似于线粒体、形态有很大变化的细胞器。其它的古虫界的生物有线粒体，线粒体嵴呈管状、盘状、薄片状。大多数古虫界物种有两个、四个甚至更多的鞭毛^[3]，很多物种有显著的腹部摄食沟（feeding groove）超微结构，内部由微管支撑。^[4]如果有系统发生的基因证据，其它缺乏这一特征的物种也可以归属于古虫界。

分类

古虫界在门/纲的级别上分为六类。

总门	门/纲	有代表性的属	描述
盘嵴亚界 Discoba或JEH	眼虫门 Euglenozoa	眼虫（Euglena）、锥虫（Trypanosoma）	很多是重要的寄生虫，很多含有色素体（叶绿体）
	透色门 Percolozoa或渗养门 Heterolobosea	耐格里原虫（Naegleria）、集胞黏菌（Acrasis）	大多数的形态在鞭毛虫与似变形虫之间
	雅各巴虫纲 Jakobea	雅各巴虫（Jakoba）、异养鞭毛虫（Reclinomonas）	自由生活，有的具鞭毛，有基因丰富的线粒体
后滴门 Metamonada或POD	纲 Preaxostyla	銳滴虫 (Oxymonads)、三鞭毛虫（Trimastix）	无线粒体，有鞭毛，或者自由生活（三鞭毛虫）或者寄生于昆虫的后肠（hindgut）
	多鞭毛虫纲 Trichozoa或Fornicata	贾第虫（Giardia）、Carpediemonas	无线粒体，大多数共生或寄生在动物体内。
	副基体纲 Parabasalia	毛滴虫属（Trichomonas）	无线粒体有鞭毛，一般共生在昆虫肠内。某些是人体寄生虫。

Discoba或JEH亚界

眼虫门（Euglenozoa）与透色门（Percolozoa, Heterolobosea）是特别接近的亲缘关系，都具有盘状的线粒体嵴，因此被归纳为盘嵴总门（Discicristata）。2007年，一项研究表明盘嵴总门与Jakobida目具有基因亲缘关系^[5] Jakobida目具有类似于其它原生生物的管状线粒体嵴，因此与盘嵴总门合称为Discoba亚界或三者首字母缩写——JEH总界。^[2]

后滴门

后滴门（Metamonad）不寻常地缺少了典型的线粒体——代替线粒体，这些生物具有氢化酶体（hydrogenosome），纺锤剩体（mitosome）或其它未识别的细胞器。共同特点是都没有线粒体。基因分析表明，这些生物的细胞核中有线粒体的基因标志。这些生物都是寄生生活的，能够从其它来源获得ATP。源真核生物的一个例子是毛滴虫（Trichomonas Vaginalis），是常见的尿路感染，通过性接触传播。

单系起源

古虫界是否为单系群（monophyletic group），仍然缺乏基因证据。可能是几个并行的进化分支。^[6]

某些古虫界的物种被认为是非常原始的真核生物，位于进化树的底部。这示意古虫界可能是多系群，包含着其它原生生物的祖先。但这也可能是由于长枝吸引（long branch attraction），这已经在微孢子虫（microsporidia）中有过前例。

马拉维单胞虫

除上述类群外马拉维单胞虫纲（Malawimonas）由于其分子系统学证据被认为可能是古虫中的一种，但其在其中的系统位置待定。^[7]

参見

• 源真核生物界


• 真核生物


• 原生生物

参考文献

1. 
   ^ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj. Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes (Free full text). Molecular Biology and Evolution. Mar 2006, 23 (3): 615–25. PMID 16308337. doi:10.1093/molbev/msj068. 
   


2. 
   ^ ^2.02.1 Hampl V, Hug L, Leigh JW; 等. Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. March 2009, 106 (10): 3859–64. Bibcode:2009PNAS..106.3859H. PMC 2656170. PMID 19237557. doi:10.1073/pnas.0807880106.  引文格式1维护：显式使用等标签 (link)
   


3. 
   ^ Simpson AG. Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1759–77. PMID 14657103. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. ^{[永久失效連結]}
   


4. 
   ^ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. 
   


5. 
   ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang. Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans. Curr. Biol. August 2007, 17 (16): 1420–1425. PMID 17689961. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. 
   


6. 
   ^ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz. Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity. PLoS Genet. December 2006, 2 (12): e220. PMC 1713255. PMID 17194223. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. 
   


7. 
   ^ Cavalier-Smith T. The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1741–58. PMID 14657102. doi:10.1099/ijs.0.02548-0. 
   

外部链接

• Tree of Life Eukaryotes


• Tree of Life: Jakobida


• Tree of Life: Fornicata

查 论 编 真核生物 域 古菌 细菌 真核生物 (界 植物 Hacrobia（英语：Template:Hacrobia） 不等鞭毛类（英语：Template:Heterokont） 囊泡虫 有孔虫（英语：Template:Rhizaria） 古虫 变形虫（英语：Template:Amoebozoa） 动物 真菌) 双鞭毛生物 多貌生物 AH 原始色素体生物(A)，或广义植物 綠植界（英语：Viridiplantae）/狭义植物 红藻门 灰胞藻门 定鞭/隐藻生物(H)（有争议） 定鞭藻门 隐藻门 中阳虫门 SAR 不等鞭毛/囊泡生物 不等鞭毛类(S) 淡色藻总门 双环总门 伪真菌总门 囊泡虫类(A) 纤毛虫门 粘孢子总门 頂複門 双鞭毛虫门 有孔虫界(R) 丝足虫类 有孔虫类 有孔虫门 放射虫门 古虫界 盘嵴亚界 眼虫门 雅各巴虫纲（英语：Jakobea） 透色门 槽虫门（英语：Loukozoa） 后滴门（英语：Metamonad） 马拉维单胞虫纲（英语：Malawimonas） 无根虫门（英语：Apusozoa） 无根单胞虫目（英语：Apusomonadida） Apusomonas Amastigomonas 弯单胞虫目（英语：Ancyromonadida） Ancyromonas 半主虫目（英语：Hemimastigida） Hemimastix Spironema Stereonema Breviata 单鞭毛生物 变形虫界 叶足亚门 锥足亚门 Phalansterium 后鞭毛生物 动物总界 Mesomycetozoea（英语：Mesomycetozoea） 肤胞虫目（英语：Dermocystida） 鱼孢霉目（英语：Ichthyophonida） 外毛菌目（英语：Eccrinales） 变形毛菌目（英语：Amoebidiales） 珊瑚壶菌属（英语：Corallochytrium） 蜷丝生物（英语：Filozoa） 蜷丝球虫纲（英语：Filasterea） 快孢子虫目（英语：Capsaspora） 小球虫目（英语：Ministeriida） 领鞭毛虫纲 领鞭毛虫 Salpingoecidae Acanthoecidae 动物界或 “后生动物” 真后生动物 两侧对称动物 刺胞动物门 栉水母门 中生动物门 菱形動物門 直泳動物門 侧生动物 扁盘动物门 多孔动物门 菌物总界 真菌界 双核亚界 子囊菌门 担子菌门 球囊菌门 接合菌门 芽枝霉门 壶菌门 新美鞭菌门 微孢子虫门 核形虫类 Nuclearia Micronuclearia Rabdiophrys Pinaciophora 泡轮虫属 Fonticula 来源: Adl et al. (2005), Adl et al. (2012), Cavalier-Smith (2008).

查 论 编 古虫界 域 古菌 细菌 真核生物 (界 植物 Hacrobia（英语：Template:Hacrobia） 不等鞭毛类（英语：Template:Heterokont） 囊泡虫 有孔虫（英语：Template:Rhizaria） 古虫 变形虫（英语：Template:Amoebozoa） 动物 真菌) 盘嵴亚界 (JEH亚界) 盘嵴总门（英语：Discicristata） 眼虫门 裸藻纲 眼虫 动质体纲：锥体虫目（英语：Trypanosomatid） 锥虫 利什曼原虫 透色门 异叶足纲 Schizopyrenida: Vahlkampfiidae Naegleria Neovahlkampfia Paravahlkampfia Psalteriomonas Sawyeria Tetramitus/Paratetramitus Vahlkampfia Willaertia Gruberellidae Stachyamoeba Rosculus Acrasidae Acrasis Heteramoeba Learamoeba Monopylocystis Stygamoeba 透色纲（英语：Percolatea） Percolomonas Stephanopogon 槽虫门（英语：Loukozoa） Andaluciida Andalucia 雅各巴虫纲（英语：Jakobea） Jakobidae Jakoba Histionidae Reclinomonas Histiona M+M 后滴门（英语：Metamonad） Trichozoa 副基体纲（英语：Parabasalid） Trichomonadida Trichomonas Dientamoeba Mixotricha Histomonas Hypermastigia Trichonympha Fornicata Eopharingia Diplomonadida: Hexamitinae Spironucleus Hexamita Giardiinae 贾第虫 Octomitus Retortamonadida Chilomastix Retortamonas 其它 Carpediemonadida Carpediemonas Dysnectes Anaeromonadea Trimastix Oxymonadida Dinenympha Pyrsonympha Oxymonas 其它 马拉维单胞虫纲（英语：Malawimonas） 医学导航: 原虫感染 变形虫, 古虫, 囊泡虫 (结构) 变形虫, 古虫, 囊泡藻 变形虫, 古虫, 囊泡藻

物種識別信息 維基數據: Q691551 維基物種: Excavata BioLib: 909021 EoL: 9096336 Fossilworks: 212581 uBio: 4170102 WoRMS: 536210

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