古虫界

























古虫界

Giardia lamblia.jpg

篮氏贾第鞭毛虫，一种人体寄生虫

科学分类 编辑
总域：
新壁總域 Neomura
域：
真核域 Eukaryota
界：
古虫界 Excavata
(Cavalier-Smith) Simpson, 2003
门



  • 眼虫门 Euglenozoa


  • 透色门 Percolozoa


  • 槽虫门 Loukozoa


  • 后滴门 Metamonada

  • Malawimonas




古虫界（学名：Excavata）是单细胞真核生物的一个大的界[1][2]。古虫界包含了许多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人体寄生虫。命名为「古虫」，是因为在真核生物的系统发生树处于底部位置，与古菌等外群关系较近，线粒体可能缺失或功能原始。




目录






  • 1 特性


  • 2 分类


    • 2.1 Discoba或JEH亚界


    • 2.2 后滴门


    • 2.3 单系起源


    • 2.4 马拉维单胞虫




  • 3 参見


  • 4 参考文献


  • 5 外部链接





特性


许多古虫界的物种缺乏典型的线粒体，被称作「无线粒体原生生物」（amitochondriate），虽然大多数可能包含了功能上类似于线粒体、形态有很大变化的细胞器。其它的古虫界的生物有线粒体，线粒体嵴呈管状、盘状、薄片状。大多数古虫界物种有两个、四个甚至更多的鞭毛[3]，很多物种有显著的腹部摄食沟（feeding groove）超微结构，内部由微管支撑。[4]如果有系统发生的基因证据，其它缺乏这一特征的物种也可以归属于古虫界。



分类


古虫界在门/纲的级别上分为六类。









































总门 门/纲 有代表性的属 描述

盘嵴亚界 Discoba或JEH
眼虫门 Euglenozoa
眼虫（Euglena）、锥虫（Trypanosoma）		 很多是重要的寄生虫，很多含有色素体（叶绿体）

透色门 Percolozoa或渗养门 Heterolobosea
耐格里原虫（Naegleria）、集胞黏菌（Acrasis）		 大多数的形态在鞭毛虫与似变形虫之间

雅各巴虫纲 Jakobea
雅各巴虫（Jakoba）、异养鞭毛虫（Reclinomonas）		 自由生活，有的具鞭毛，有基因丰富的线粒体

后滴门 Metamonada或POD		 纲 Preaxostyla
銳滴虫 (Oxymonads)、三鞭毛虫（Trimastix）		 无线粒体，有鞭毛，或者自由生活（三鞭毛虫）或者寄生于昆虫的后肠（hindgut）

多鞭毛虫纲 Trichozoa或Fornicata
贾第虫（Giardia）、Carpediemonas
 无线粒体，大多数共生或寄生在动物体内。

副基体纲 Parabasalia
毛滴虫属（Trichomonas）		 无线粒体有鞭毛，一般共生在昆虫肠内。某些是人体寄生虫。


Discoba或JEH亚界


眼虫门（Euglenozoa）与透色门（Percolozoa, Heterolobosea）是特别接近的亲缘关系，都具有盘状的线粒体嵴，因此被归纳为盘嵴总门（Discicristata）。2007年，一项研究表明盘嵴总门与Jakobida目具有基因亲缘关系[5] Jakobida目具有类似于其它原生生物的管状线粒体嵴，因此与盘嵴总门合称为Discoba亚界或三者首字母缩写——JEH总界。[2]



后滴门


后滴门（Metamonad）不寻常地缺少了典型的线粒体——代替线粒体，这些生物具有氢化酶体（hydrogenosome），纺锤剩体（mitosome）或其它未识别的细胞器。共同特点是都没有线粒体。基因分析表明，这些生物的细胞核中有线粒体的基因标志。这些生物都是寄生生活的，能够从其它来源获得ATP。源真核生物的一个例子是毛滴虫（Trichomonas Vaginalis），是常见的尿路感染，通过性接触传播。



单系起源


古虫界是否为单系群（monophyletic group），仍然缺乏基因证据。可能是几个并行的进化分支。[6]


某些古虫界的物种被认为是非常原始的真核生物，位于进化树的底部。这示意古虫界可能是多系群，包含着其它原生生物的祖先。但这也可能是由于长枝吸引（long branch attraction），这已经在微孢子虫（microsporidia）中有过前例。



马拉维单胞虫


除上述类群外马拉维单胞虫纲（Malawimonas）由于其分子系统学证据被认为可能是古虫中的一种，但其在其中的系统位置待定。[7]



参見



  • 源真核生物界

  • 真核生物

  • 原生生物



参考文献




  1. ^ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj. Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes (Free full text). Molecular Biology and Evolution. Mar 2006, 23 (3): 615–25. PMID 16308337. doi:10.1093/molbev/msj068. 


  2. ^ 2.02.1 Hampl V, Hug L, Leigh JW; 等. Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. March 2009, 106 (10): 3859–64. Bibcode:2009PNAS..106.3859H. PMC 2656170. PMID 19237557. doi:10.1073/pnas.0807880106.  引文格式1维护：显式使用等标签 (link)


  3. ^ Simpson AG. Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1759–77. PMID 14657103. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. [永久失效連結]


  4. ^ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. 


  5. ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang. Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans. Curr. Biol. August 2007, 17 (16): 1420–1425. PMID 17689961. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. 


  6. ^ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz. Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity. PLoS Genet. December 2006, 2 (12): e220. PMC 1713255. PMID 17194223. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. 


  7. ^ Cavalier-Smith T. The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1741–58. PMID 14657102. doi:10.1099/ijs.0.02548-0. 



外部链接



  • Tree of Life Eukaryotes

  • Tree of Life: Jakobida

  • Tree of Life: Fornicata




















  • 查

  • 论

  • 编


真核生物



域

古菌

细菌

真核生物

(界

植物

Hacrobia（英语：Template:Hacrobia）

不等鞭毛类（英语：Template:Heterokont）

囊泡虫

有孔虫（英语：Template:Rhizaria）

古虫

变形虫（英语：Template:Amoebozoa）

动物


真菌)


双鞭毛生物
















多貌生物











AH












原始色素体生物(A)，或广义植物



  • 綠植界（英语：Viridiplantae）/狭义植物

  • 红藻门

  • 灰胞藻门

定鞭/隐藻生物(H)（有争议）


  • 定鞭藻门

  • 隐藻门

  • 中阳虫门


SAR











不等鞭毛/囊泡生物












不等鞭毛类(S)


  • 淡色藻总门

  • 双环总门

  • 伪真菌总门

囊泡虫类(A)


  • 纤毛虫门


  • 粘孢子总门

    • 頂複門

    • 双鞭毛虫门



有孔虫界(R)


  • 丝足虫类


  • 有孔虫类

    • 有孔虫门

    • 放射虫门




古虫界



  • 盘嵴亚界

    • 眼虫门

    • 雅各巴虫纲（英语：Jakobea）

    • 透色门

    • 槽虫门（英语：Loukozoa）



  • 后滴门（英语：Metamonad）

  • 马拉维单胞虫纲（英语：Malawimonas）
无根虫门（英语：Apusozoa）



  • 无根单胞虫目（英语：Apusomonadida）

    • Apusomonas

    • Amastigomonas




  • 弯单胞虫目（英语：Ancyromonadida）
    • Ancyromonas



  • 半主虫目（英语：Hemimastigida）

    • Hemimastix

    • Spironema

    • Stereonema



  • Breviata


单鞭毛生物











变形虫界


  • 叶足亚门


  • 锥足亚门
    • Phalansterium
后鞭毛生物











动物总界











Mesomycetozoea（英语：Mesomycetozoea）


  • 肤胞虫目（英语：Dermocystida）

  • 鱼孢霉目（英语：Ichthyophonida）

  • 外毛菌目（英语：Eccrinales）

  • 变形毛菌目（英语：Amoebidiales）

  • 珊瑚壶菌属（英语：Corallochytrium）
蜷丝生物（英语：Filozoa）
















蜷丝球虫纲（英语：Filasterea）


  • 快孢子虫目（英语：Capsaspora）

  • 小球虫目（英语：Ministeriida）
领鞭毛虫纲


  • 领鞭毛虫

  • Salpingoecidae

  • Acanthoecidae
动物界或
“后生动物”



  • 真后生动物

    • 两侧对称动物

    • 刺胞动物门

    • 栉水母门




  • 中生动物门

    • 菱形動物門

    • 直泳動物門




  • 侧生动物

    • 扁盘动物门

    • 多孔动物门




菌物总界











真菌界



  • 双核亚界

    • 子囊菌门

    • 担子菌门



  • 球囊菌门

  • 接合菌门

  • 芽枝霉门

  • 壶菌门

  • 新美鞭菌门

  • 微孢子虫门
核形虫类


  • Nuclearia

  • Micronuclearia

  • Rabdiophrys

  • Pinaciophora

  • 泡轮虫属

  • Fonticula






来源: Adl et al. (2005), Adl et al. (2012), Cavalier-Smith (2008).





















物種識別信息


  • 維基數據: Q691551

  • 維基物種: Excavata

  • BioLib: 909021

  • EoL: 9096336

  • Fossilworks: 212581

  • uBio: 4170102

  • WoRMS: 536210



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